Las líneas de investigación propuestos por el programa para el desarrollo de la tesis son:

·       Línea: Pensamiento Cristiano

            Esta línea de investigación se enfoca en la reflexión bíblica teológica en sus dimensiones históricas y metodológicas considerando la manera que se relaciona con la vida del individuo, la comunidad de fe, la sociedad y la creación.

·       Línea: Misión

            Esta línea de investigación se enfoca en estudiar cómo se establece la Missio Dei (misión de Dios) a través del cruce intencional de barreras entre iglesia a no iglesia, de fe a no fe, para proclamar por palabra y obra la venida del reino de Dios en Jesucristo con la visión de transformar al mundo

·       Línea: Contextualización

Esta línea de investigación se enfoca en la aplicabilidad contextual de las cinco grandes temáticas teológicas: adoración (liturgia), proclamación (kerigma), enseñanza/ discipulado (didajé), comunión/nueva humanidad (koinonia) y servicio social (diakonia)